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MapReduce的ReduceTask任务的运行源码级分析
阅读量:4610 次
发布时间:2019-06-09

本文共 32896 字,大约阅读时间需要 109 分钟。

   这篇文章好不容易恢复了。。。谢天谢地。。。这篇文章讲了MapTask的执行流程。咱们这一节讲解ReduceTask的执行流程。ReduceTask也有四种任务,可参考前一章节对应的内容,至于Reduce Task要从各个Map Task上读取一片数据,经过排序后,以组为单位交给用户编写的reduce方法,并将结果写入HDFS中。

  MapTask和ReduceTask都是Task的子类,分别对应于我们常说的map和reduce任务。同上一节一样Child类中直接运行的是run方法,ReduceTask.run()方法代码如下:

1  //ReduceTask.run方法开始和MapTask类似,包括initialize()初始化,根据情况看是否调用runJobCleanupTask(),  2   //runJobSetupTask(),runTaskCleanupTask()。之后进入正式的工作,主要有这么三个步骤:Copy、Sort、Reduce。  3   @Override  4   @SuppressWarnings("unchecked")  5   public void run(JobConf job, final TaskUmbilicalProtocol umbilical)  6     throws IOException, InterruptedException, ClassNotFoundException {  7     this.umbilical = umbilical;  8     job.setBoolean("mapred.skip.on", isSkipping());  9     /*添加reduce过程需要经过的几个阶段。以便通知TaskTracker目前运   行的情况*/  10     if (isMapOrReduce()) { 11       copyPhase = getProgress().addPhase("copy"); 12       sortPhase  = getProgress().addPhase("sort"); 13       reducePhase = getProgress().addPhase("reduce"); 14     } 15     // start thread that will handle communication with parent 16  // 设置并启动reporter进程以便和TaskTracker进行交流  17     TaskReporter reporter = new TaskReporter(getProgress(), umbilical, 18         jvmContext); 19     reporter.startCommunicationThread(); 20     //在job client中初始化job时,默认就是用新的API,详见Job.setUseNewAPI()方法 21     boolean useNewApi = job.getUseNewReducer();         22     /*用来初始化任务,主要是进行一些和任务输出相关的设置,比如创建commiter,设置工作目录等*/  23     initialize(job, getJobID(), reporter, useNewApi);//这里将会处理输出目录 24     /*以下4个if语句均是根据任务类型的不同进行相应的操作,这些方 法均是Task类的方法,所以与任务是MapTask还是ReduceTask无关*/  25     // check if it is a cleanupJobTask 26     if (jobCleanup) { 27       runJobCleanupTask(umbilical, reporter); 28       return; 29     } 30     if (jobSetup) { 31         //主要是创建工作目录的FileSystem对象 32       runJobSetupTask(umbilical, reporter); 33       return; 34     } 35     if (taskCleanup) { 36          //设置任务目前所处的阶段为结束阶段,并且删除工作目录  37       runTaskCleanupTask(umbilical, reporter); 38       return; 39     } 40      41     // Initialize the codec 42     codec = initCodec(); 43  44     boolean isLocal = "local".equals(job.get("mapred.job.tracker", "local"));  //判断是否是单机hadoop 45     if (!isLocal) { 46         //1. Copy.就是从执行各个Map任务的服务器那里,收到map的输出文件。拷贝的任务,是由ReduceTask.ReduceCopier 类来负责。 47         //ReduceCopier对象负责将Map函数的输出拷贝至Reduce所在机器  48       reduceCopier = new ReduceCopier(umbilical, job, reporter); 49       if (!reduceCopier.fetchOutputs()) {
fetchOutputs函数负责拷贝各个Map函数的输出 50 if(reduceCopier.mergeThrowable instanceof FSError) { 51 throw (FSError)reduceCopier.mergeThrowable; 52 } 53 throw new IOException("Task: " + getTaskID() + 54 " - The reduce copier failed", reduceCopier.mergeThrowable); 55 } 56 } 57 copyPhase.complete(); // copy is already complete 58 setPhase(TaskStatus.Phase.SORT); 59 statusUpdate(umbilical); 60 61 final FileSystem rfs = FileSystem.getLocal(job).getRaw(); 62 //2.Sort(其实相当于合并).排序工作,就相当于上述排序工作的一个延续。它会在所有的文件都拷贝完毕后进行。 63 //使用工具类Merger归并所有的文件。经过这一个流程,一个合并了所有所需Map任务输出文件的新文件产生了。 64 //而那些从其他各个服务器网罗过来的 Map任务输出文件,全部删除了。 65 66 //根据hadoop是否分布式来决定调用哪种排序方式 67 RawKeyValueIterator rIter = isLocal 68 ? Merger.merge(job, rfs, job.getMapOutputKeyClass(), 69 job.getMapOutputValueClass(), codec, getMapFiles(rfs, true), 70 !conf.getKeepFailedTaskFiles(), job.getInt("io.sort.factor", 100), 71 new Path(getTaskID().toString()), job.getOutputKeyComparator(), 72 reporter, spilledRecordsCounter, null) 73 : reduceCopier.createKVIterator(job, rfs, reporter); 74 75 // free up the data structures 76 mapOutputFilesOnDisk.clear(); 77 78 sortPhase.complete(); // sort is complete 79 setPhase(TaskStatus.Phase.REDUCE); 80 statusUpdate(umbilical); 81 //3.Reduce 1.Reduce任务的最后一个阶段。它会准备好Map的 keyClass("mapred.output.key.class"或"mapred.mapoutput.key.class"), 82 //valueClass("mapred.mapoutput.value.class"或"mapred.output.value.class") 83 //和 Comparator (“mapred.output.value.groupfn.class”或 “mapred.output.key.comparator.class”) 84 Class keyClass = job.getMapOutputKeyClass(); 85 Class valueClass = job.getMapOutputValueClass(); 86 RawComparator comparator = job.getOutputValueGroupingComparator(); 87 //2.根据参数useNewAPI判断执行runNewReduce还是runOldReduce。分析润runNewReduce 88 if (useNewApi) { 89 //3.runNewReducer 90 //0.像报告进程书写一些信息 91 //1.获得一个TaskAttemptContext对象。通过这个对象创建reduce、output及用于跟踪的统计output的RecordWrit、最后创建用于收集reduce结果的Context 92 //2.reducer.run(reducerContext)开始执行reduce 93 runNewReducer(job, umbilical, reporter, rIter, comparator, 94 keyClass, valueClass); 95 } else { 96 runOldReducer(job, umbilical, reporter, rIter, comparator, 97 keyClass, valueClass); 98 } 99 done(umbilical, reporter);100 }

  (1)reduce分为三个阶段(copy就是远程拷贝Map的输出数据、sort就是对所有的数据做排序、reduce做聚集就是我们自己写的reducer),为这三个阶段分别设置Progress,用来和TaskTracker通信报道状态。

  (2)上面代码的15-40行和 中对应部分基本相同,可参考之;

  (3)codec = initCodec()这句是检查map的输出是否是压缩的,压缩的则返回压缩codec实例,否则返回null,这里讨论不压缩的;

  (4)我们讨论完全分布式的hadoop,即isLocal==false,然后构造一个ReduceCopier对象reduceCopier,并调用reduceCopier.fetchOutputs()方法拷贝各个Mapper的输出,到本地;

  (5)然后copy阶段完成,设置接下来的阶段是sort阶段,更新状态信息;

  (6)根据isLocal来选择KV迭代器,完全分布式的会使用reduceCopier.createKVIterator(job, rfs, reporter)作为KV迭代器;

  (7)sort阶段完成,设置接下来的阶段是reduce阶段,更新状态信息;

  (8)然后获取一些配置信息,并根据是否使用新API选择不同的处理方式,这里是新的API,调用runNewReducer(job, umbilical, reporter, rIter, comparator, keyClass, valueClass)会执行reducer;

  (9)done(umbilical, reporter)这个方法用于做结束任务的一些清理工作:更新计数器updateCounters();如果任务需要提交,设置Taks状态为COMMIT_PENDING,并利用TaskUmbilicalProtocol,汇报Task完成,等待提交,然后调用commit提交任务;设置任务结束标志位;结束Reporter通信线程;发送最后一次统计报告(通过sendLastUpdate方法);利用TaskUmbilicalProtocol报告结束状态(通过sendDone方法)。

  有些人将Reduce Task分为了5个阶段:一、shuffle阶段:也称为Copy阶段,就是从各个MapTask上远程拷贝一片数据,如果大小超过一定阈值就写到磁盘,否则放入内存;二、Merge阶段:在远程拷贝数据的同时,Reduce Task启动了两个后台线程对内存和磁盘上的文件进行合并,防止内存使用过多和磁盘文件过多;三、sort阶段:用户编写的reduce方法的输入数据是按key进行聚集的,需要对copy过来的数据排序,这里用的是归并排序,因为Map Task的结果是有序的;四、Reduce阶段:将每组数据依次交给用户编写的Reduce方法处理;五、write阶段:就是将结果写入HDFS。

  上面的5个阶段分的比较细了,代码里分为3个阶段copy、sort、reduce,我们在eclipse运行MR程序时,控制台看到的reduce阶段的百分比就分为3个阶段各占33.3%。

  接下来重点将两个个地方:runNewReducer方法和ReduceCopier类,后者有2000多行代码,占据了ReduceTask类的绝大部分代码量。

  A、我们先看runNewReducer吧,这个比ReduceCopier更容易一些,代码如下:

1 @SuppressWarnings("unchecked") 2   private 
3 void runNewReducer(JobConf job, 4 final TaskUmbilicalProtocol umbilical, 5 final TaskReporter reporter, 6 RawKeyValueIterator rIter, 7 RawComparator
comparator, 8 Class
keyClass, 9 Class
valueClass10 ) throws IOException,InterruptedException, 11 ClassNotFoundException {12 // wrap value iterator to report progress.13 final RawKeyValueIterator rawIter = rIter;14 rIter = new RawKeyValueIterator() {15 public void close() throws IOException {16 rawIter.close();17 }18 public DataInputBuffer getKey() throws IOException {19 return rawIter.getKey();20 }21 public Progress getProgress() {22 return rawIter.getProgress();23 }24 public DataInputBuffer getValue() throws IOException {25 return rawIter.getValue();26 }27 public boolean next() throws IOException {28 boolean ret = rawIter.next();29 reducePhase.set(rawIter.getProgress().get());30 reporter.progress();31 return ret;32 }33 };34 // make a task context so we can get the classes35 /*TaskAttemptContext类继承于JobContext类,相对于JobContext类增加了一些有关task的信息。通过taskContext对象可以获得很多与任务执行相36 关的类,比如用户定义的Mapper类,InputFormat类等等 */ 37 org.apache.hadoop.mapreduce.TaskAttemptContext taskContext =38 new org.apache.hadoop.mapreduce.TaskAttemptContext(job, getTaskID());39 // make a reducer40 //创建用户定义的Reduce类的实例 41 org.apache.hadoop.mapreduce.Reducer
reducer =42 (org.apache.hadoop.mapreduce.Reducer
)43 ReflectionUtils.newInstance(taskContext.getReducerClass(), job);44 45 org.apache.hadoop.mapreduce.RecordWriter
trackedRW = 46 new NewTrackingRecordWriter
(reduceOutputCounter,47 job, reporter, taskContext);48 job.setBoolean("mapred.skip.on", isSkipping());49 org.apache.hadoop.mapreduce.Reducer.Context 50 reducerContext = createReduceContext(reducer, job, getTaskID(),51 rIter, reduceInputKeyCounter,52 reduceInputValueCounter, 53 trackedRW, committer,54 reporter, comparator, keyClass,55 valueClass);56 reducer.run(reducerContext);57 trackedRW.close(reducerContext);58 }
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  (1)参数RawKeyValueIterator rIter实际上是org.apache.hadoop.mapred.Merger.MergeQueue。这里将rIter赋值给新的RawKeyValueIterator rawIter,然后将rIter重新实现了RawKeyValueIterator,可以跟踪和汇报rawIter进度;

  (2)构造任务配置类以及获取用户自己的Reducer类的实例,然后创建一个NewTrackingRecordWriter的对象trackedRW作为输出; 

  (3)将rIter、trackedRW等信息传递给org.apache.hadoop.mapreduce.Reducer.Context ,构造了一个管理读写的配置对象;在其父类ReduceContext中对输入就是迭代器的操作进行了实现;在ReduceContext的父类TaskInputOutputContext中实现输出的方法,其write方法会直接调用trackedRW.write(key,value)

  (4)reducer.run(reducerContext)执行reducer的run方法,这个run方法和上一节中的基本相同,可参考之;

  (5)关闭输出trackedRW.close(reducerContext)。

  一、这里还得解释一下NewTrackingRecordWriter这个管理输出的类,是mapreduce.RecordWriter的子类,和上一节中的NewDirectOutputCollector较为类似,这里不再讲解。

  二、至于输入数据rIter迭代器,在此需要解释一下,实现同一个key的不同value迭代读取的功能在ReduceContext中,讲之前,我们先看一下Reducer.run()方法的代码吧:  

1 public void run(Context context) throws IOException, InterruptedException {2     setup(context);3     while (context.nextKey()) {4       reduce(context.getCurrentKey(), context.getValues(), context);5     }6     cleanup(context);7   }

  我们只说while循环这一部分,其他部分前一小节有讲解,基本类似。while的循环条件是ReduceContext.nextKey()为真,这个方法就在ReduceContext中实现的,这个方法的目的就是处理下一个唯一的key(就是要保证是新的key),因为reduce方法的输入数据是分组的,所以每次都会处理一个key及这个key对应的所有value,又因为已经将所有的Map Task的输出拷贝过来而且做了排序,所以key相同的KV对都是挨着的。来看nextKey()方法代码:

1 /** Start processing next unique key. */ 2   public boolean nextKey() throws IOException,InterruptedException { 3     while (hasMore && nextKeyIsSame) {    //如果还有数据并且下一个KV中的K与当前的相同就一直循环直到key不相同,一般不会执行这个,因为value的迭代器会迭代到nextKeyIsSame==false 4       nextKeyValue(); 5     } 6     if (hasMore) {    //如果还有数据 7       if (inputKeyCounter != null) { 8         inputKeyCounter.increment(1);    //统计 9       }10       return nextKeyValue();    //推进到下一个KV11     } else {12       return false;13     }14   }
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  上述方法会调用另外一个方法nextKeyValue()会尝试去获取下一个key值,并且如果没数据了就会返回false,如果还有数据就返回true,具体代码如下:

1 public boolean nextKeyValue() throws IOException, InterruptedException { 2     if (!hasMore) { 3       key = null; 4       value = null; 5       return false; 6     } 7     firstValue = !nextKeyIsSame;        //这个是否是同一个key值的不同value,第一个value的话firstValue==true并且nextKeyIsSame==false,后续的会是false,nextKeyIsSame是true 8     DataInputBuffer next = input.getKey(); 9     currentRawKey.set(next.getData(), next.getPosition(), 10                       next.getLength() - next.getPosition());11     buffer.reset(currentRawKey.getBytes(), 0, currentRawKey.getLength());12     key = keyDeserializer.deserialize(key);        //反序列化获取key值13     next = input.getValue();14     buffer.reset(next.getData(), next.getPosition(), next.getLength());15     value = valueDeserializer.deserialize(value);    //反序列化获取value值16     hasMore = input.next();        //是否还有数据17     if (hasMore) {18       next = input.getKey();19       nextKeyIsSame = comparator.compare(currentRawKey.getBytes(), 0, 20                                          currentRawKey.getLength(),21                                          next.getData(),22                                          next.getPosition(),23                                          next.getLength() - next.getPosition()24                                          ) == 0;        //查看下一个KV的key是否与当前的一样25     } else {            //没有数据了26       nextKeyIsSame = false;27     }28     inputValueCounter.increment(1);29     return true;30   }
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  这里面有两个比较重要的参数:firstValue表示是否是当前key值的第一个value;nextKeyIsSame表示下一个key是否和当前key值相同。这两个参数在迭代获取value的时候会有重要作用。在这个方法中会获取key和value,可以通过getCurrentKey()和getCurrentValue()方法来获取这两个值。这个方法还会读取下一个key与当前的key作比较,如果相同则nextKeyIsSame=true,否则nextKeyIsSame=false。

  此时我们再返回到run()方法中,循环条件已了解,那么循环体的秘密呢?用户自己的reduce方法还记得么?一个key和一个这个key对应的value迭代器,没错在这分别对应context.getCurrentKey()和context.getValues()。下面我们重点研究一下后者context.getValues(),这个方法也在ReduceContext类中,这个方法主要是返回一个可迭代对象ValueIterable,它封装了迭代器ValueIterator,这个迭代器实现了对value的迭代读取,这个类的全部代码如下:

1 protected class ValueIterator implements Iterator
{ 2 3 @Override 4 public boolean hasNext() { 5 return firstValue || nextKeyIsSame; 6 } 7 8 @Override 9 public VALUEIN next() {10 // if this is the first record, we don't need to advance11 if (firstValue) {12 firstValue = false;13 return value;14 }15 // if this isn't the first record and the next key is different, they16 // can't advance it here.17 if (!nextKeyIsSame) {18 throw new NoSuchElementException("iterate past last value");19 }20 // otherwise, go to the next key/value pair21 try { //firstValue==false and nextKeyIsSame == true22 nextKeyValue();23 return value;24 } catch (IOException ie) {25 throw new RuntimeException("next value iterator failed", ie);26 } catch (InterruptedException ie) {27 // this is bad, but we can't modify the exception list of java.util28 throw new RuntimeException("next value iterator interrupted", ie); 29 }30 }31 32 @Override33 public void remove() {34 throw new UnsupportedOperationException("remove not implemented");35 }36 37 }
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  hasNext()判断是否还有下一个value,由上面说的firstValue和nextKeyIsSame决定,只要有一个是true就说明有下一个value,为什么呢,请看上面对着两个参数的解释,自行理解吧,很明显。

  next()方法就是读取value的地方,这有几种情况需要分析:1、如果firstValue==true,则直接返回当前的value,大伙这没问题吧;2、如果firstValue==false and nextKeyIsSame == false,这明显不科学,哪有下一个key不相同且又不是第一个value的情况呢?所以报错;3、如果firstValue==false and nextKeyIsSame == true 说明下一个KV的key和当前key相同且不是第一个value,可能是第N个,所以需要调用nextKeyValue()获取下一个value并返回。reduce就是通过这种机制不断去获取同一个key的所有valude的。

  这个上面二中的输入数据迭代器就明了了。

  B、下面就是ReduceCopier类了,这个类承载的工作量很大,也比较复杂。

  重点的方法是ReduceCopier.fetchOutputs()这个方法负责拷贝各个Map函数的输出,代码也比较多接近400行,代码如下,里面有一些注释:

1  //通过ReduceCopier的fetchOutputs()方法取得map的结果  2     public boolean fetchOutputs() throws IOException {  3       int totalFailures = 0;  4       int            numInFlight = 0, numCopied = 0;  5       DecimalFormat  mbpsFormat = new DecimalFormat("0.00");  6       final Progress copyPhase =   7         reduceTask.getProgress().phase();  8       //(4)同时合并,还有一个内存Merger线程InMemFSMergeThread和一个文件Merger线程LocalFSMerger在同步工作,  9       //它们将下载过来的文件(可能在内存中,简单的统称为文件...),做着归并排序,以此,节约时间,降低输入文件的数量, 10       //为后续的排序工作减   负。InMemFSMergeThread的run循环调用doInMemMerge,该方法使用工具类Merger实现归并, 11       //如果需要combine,则combinerRunner.combine。 12       LocalFSMerger localFSMergerThread = null; 13       InMemFSMergeThread inMemFSMergeThread = null; 14       //(1)索取任务。使用GetMapEventsThread线程。 15       //该线程的run方法不停的调用getMapCompletionEvents方法, 16       //该方法又使用RPC调用TaskUmbilicalProtocol协议的getMapCompletionEvents, 17       //方法使用所属的jobID向其父TaskTracker询问此作业个Map任务  的完成状况 18       //(TaskTracker要向JobTracker询问后再转告给它...)。返回一个数组TaskCompletionEvent events[]。 19       //TaskCompletionEvent包含taskid和ip地址之类的信息。 20       GetMapEventsThread getMapEventsThread = null; 21        22       for (int i = 0; i < numMaps; i++) { 23         copyPhase.addPhase();       // add sub-phase per file 24       } 25        26       copiers = new ArrayList
(numCopiers); 27 28 // start all the copying threads 29 for (int i=0; i < numCopiers; i++) { 30 //(2)当获取到相关Map任务执行服务器的信息后,有一个线程MapOutputCopier开启,做具体的拷贝工作。 31 //它会在一个单独的线程内,负责某个Map任务服务器上文件的拷贝工作。MapOutputCopier的run循环调用 32 //copyOutput,copyOutput又调用 getMapOutput,使用HTTP远程拷贝。 33 MapOutputCopier copier = new MapOutputCopier(conf, reporter, 34 reduceTask.getJobTokenSecret()); 35 copiers.add(copier); 36 copier.start(); 37 } 38 39 //start the on-disk-merge thread 40 localFSMergerThread = new LocalFSMerger((LocalFileSystem)localFileSys); 41 //start the in memory merger thread 42 inMemFSMergeThread = new InMemFSMergeThread(); 43 localFSMergerThread.start(); 44 inMemFSMergeThread.start(); 45 46 // start the map events thread 47 getMapEventsThread = new GetMapEventsThread(); 48 getMapEventsThread.start(); 49 50 // start the clock for bandwidth measurement 51 long startTime = System.currentTimeMillis(); 52 long currentTime = startTime; 53 long lastProgressTime = startTime; 54 long lastOutputTime = 0; 55 56 // loop until we get all required outputs 57 while (copiedMapOutputs.size() < numMaps && mergeThrowable == null) { 58 59 currentTime = System.currentTimeMillis(); 60 boolean logNow = false; 61 if (currentTime - lastOutputTime > MIN_LOG_TIME) { 62 lastOutputTime = currentTime; 63 logNow = true; 64 } 65 if (logNow) { 66 LOG.info(reduceTask.getTaskID() + " Need another " 67 + (numMaps - copiedMapOutputs.size()) + " map output(s) " 68 + "where " + numInFlight + " is already in progress"); 69 } 70 71 // Put the hash entries for the failed fetches. 72 Iterator
locItr = retryFetches.iterator(); 73 74 while (locItr.hasNext()) { 75 MapOutputLocation loc = locItr.next(); 76 List
locList = 77 mapLocations.get(loc.getHost()); 78 79 // Check if the list exists. Map output location mapping is cleared 80 // once the jobtracker restarts and is rebuilt from scratch. 81 // Note that map-output-location mapping will be recreated and hence 82 // we continue with the hope that we might find some locations 83 // from the rebuild map. 84 if (locList != null) { 85 // Add to the beginning of the list so that this map is 86 //tried again before the others and we can hasten the 87 //re-execution of this map should there be a problem 88 locList.add(0, loc); 89 } 90 } 91 92 if (retryFetches.size() > 0) { 93 LOG.info(reduceTask.getTaskID() + ": " + 94 "Got " + retryFetches.size() + 95 " map-outputs from previous failures"); 96 } 97 // clear the "failed" fetches hashmap 98 retryFetches.clear(); 99 100 // now walk through the cache and schedule what we can101 int numScheduled = 0;102 int numDups = 0;103 104 synchronized (scheduledCopies) {105 106 // Randomize the map output locations to prevent 107 // all reduce-tasks swamping the same tasktracker108 List
hostList = new ArrayList
();109 hostList.addAll(mapLocations.keySet()); 110 111 Collections.shuffle(hostList, this.random);//混洗,降低热点的出现112 113 Iterator
hostsItr = hostList.iterator();114 115 while (hostsItr.hasNext()) {116 117 String host = hostsItr.next();118 119 List
knownOutputsByLoc = 120 mapLocations.get(host);121 122 // Check if the list exists. Map output location mapping is 123 // cleared once the jobtracker restarts and is rebuilt from 124 // scratch.125 // Note that map-output-location mapping will be recreated and 126 // hence we continue with the hope that we might find some 127 // locations from the rebuild map and add then for fetching.128 if (knownOutputsByLoc == null || knownOutputsByLoc.size() == 0) {129 continue;130 }131 132 //Identify duplicate hosts here133 if (uniqueHosts.contains(host)) {134 numDups += knownOutputsByLoc.size(); 135 continue;136 }137 138 Long penaltyEnd = penaltyBox.get(host);139 boolean penalized = false;140 141 if (penaltyEnd != null) {142 if (currentTime < penaltyEnd.longValue()) {143 penalized = true;144 } else {145 penaltyBox.remove(host);146 }147 }148 149 if (penalized)150 continue;151 152 synchronized (knownOutputsByLoc) {153 154 locItr = knownOutputsByLoc.iterator();155 156 while (locItr.hasNext()) {157 158 MapOutputLocation loc = locItr.next();159 160 // Do not schedule fetches from OBSOLETE maps161 if (obsoleteMapIds.contains(loc.getTaskAttemptId())) {162 locItr.remove();163 continue;164 }165 166 uniqueHosts.add(host);167 scheduledCopies.add(loc);168 locItr.remove(); // remove from knownOutputs169 numInFlight++; numScheduled++;170 171 break; //we have a map from this host172 }173 }174 }175 scheduledCopies.notifyAll();176 }177 178 if (numScheduled > 0 || logNow) {179 LOG.info(reduceTask.getTaskID() + " Scheduled " + numScheduled +180 " outputs (" + penaltyBox.size() +181 " slow hosts and" + numDups + " dup hosts)");182 }183 184 if (penaltyBox.size() > 0 && logNow) {185 LOG.info("Penalized(slow) Hosts: ");186 for (String host : penaltyBox.keySet()) {187 LOG.info(host + " Will be considered after: " + 188 ((penaltyBox.get(host) - currentTime)/1000) + " seconds.");189 }190 }191 192 // if we have no copies in flight and we can't schedule anything193 // new, just wait for a bit194 try {195 if (numInFlight == 0 && numScheduled == 0) {196 // we should indicate progress as we don't want TT to think197 // we're stuck and kill us198 reporter.progress();199 Thread.sleep(5000);200 }201 } catch (InterruptedException e) { } // IGNORE202 203 while (numInFlight > 0 && mergeThrowable == null) {204 LOG.debug(reduceTask.getTaskID() + " numInFlight = " + 205 numInFlight);206 //the call to getCopyResult will either 207 //1) return immediately with a null or a valid CopyResult object,208 // or209 //2) if the numInFlight is above maxInFlight, return with a 210 // CopyResult object after getting a notification from a 211 // fetcher thread, 212 //So, when getCopyResult returns null, we can be sure that213 //we aren't busy enough and we should go and get more mapcompletion214 //events from the tasktracker215 CopyResult cr = getCopyResult(numInFlight);216 217 if (cr == null) {218 break;219 }220 221 if (cr.getSuccess()) { // a successful copy222 numCopied++;223 lastProgressTime = System.currentTimeMillis();224 reduceShuffleBytes.increment(cr.getSize());225 226 long secsSinceStart = 227 (System.currentTimeMillis()-startTime)/1000+1;228 float mbs = ((float)reduceShuffleBytes.getCounter())/(1024*1024);229 float transferRate = mbs/secsSinceStart;230 231 copyPhase.startNextPhase();232 copyPhase.setStatus("copy (" + numCopied + " of " + numMaps 233 + " at " +234 mbpsFormat.format(transferRate) + " MB/s)");235 236 // Note successful fetch for this mapId to invalidate237 // (possibly) old fetch-failures238 fetchFailedMaps.remove(cr.getLocation().getTaskId());239 } else if (cr.isObsolete()) {240 //ignore241 LOG.info(reduceTask.getTaskID() + 242 " Ignoring obsolete copy result for Map Task: " + 243 cr.getLocation().getTaskAttemptId() + " from host: " + 244 cr.getHost());245 } else {246 retryFetches.add(cr.getLocation());247 248 // note the failed-fetch249 TaskAttemptID mapTaskId = cr.getLocation().getTaskAttemptId();250 TaskID mapId = cr.getLocation().getTaskId();251 252 totalFailures++;253 Integer noFailedFetches = 254 mapTaskToFailedFetchesMap.get(mapTaskId);255 noFailedFetches = 256 (noFailedFetches == null) ? 1 : (noFailedFetches + 1);257 mapTaskToFailedFetchesMap.put(mapTaskId, noFailedFetches);258 LOG.info("Task " + getTaskID() + ": Failed fetch #" + 259 noFailedFetches + " from " + mapTaskId);260 261 if (noFailedFetches >= abortFailureLimit) {262 LOG.fatal(noFailedFetches + " failures downloading "263 + getTaskID() + ".");264 umbilical.shuffleError(getTaskID(),265 "Exceeded the abort failure limit;"266 + " bailing-out.", jvmContext);267 }268 269 checkAndInformJobTracker(noFailedFetches, mapTaskId,270 cr.getError().equals(CopyOutputErrorType.READ_ERROR));271 272 // note unique failed-fetch maps273 if (noFailedFetches == maxFetchFailuresBeforeReporting) {274 fetchFailedMaps.add(mapId);275 276 // did we have too many unique failed-fetch maps?277 // and did we fail on too many fetch attempts?278 // and did we progress enough279 // or did we wait for too long without any progress?280 281 // check if the reducer is healthy282 boolean reducerHealthy = 283 (((float)totalFailures / (totalFailures + numCopied)) 284 < MAX_ALLOWED_FAILED_FETCH_ATTEMPT_PERCENT);285 286 // check if the reducer has progressed enough287 boolean reducerProgressedEnough = 288 (((float)numCopied / numMaps) 289 >= MIN_REQUIRED_PROGRESS_PERCENT);290 291 // check if the reducer is stalled for a long time292 // duration for which the reducer is stalled293 int stallDuration = 294 (int)(System.currentTimeMillis() - lastProgressTime);295 // duration for which the reducer ran with progress296 int shuffleProgressDuration = 297 (int)(lastProgressTime - startTime);298 // min time the reducer should run without getting killed299 int minShuffleRunDuration = 300 (shuffleProgressDuration > maxMapRuntime) 301 ? shuffleProgressDuration 302 : maxMapRuntime;303 boolean reducerStalled = 304 (((float)stallDuration / minShuffleRunDuration) 305 >= MAX_ALLOWED_STALL_TIME_PERCENT);306 307 // kill if not healthy and has insufficient progress308 if ((fetchFailedMaps.size() >= maxFailedUniqueFetches ||309 fetchFailedMaps.size() == (numMaps - copiedMapOutputs.size()))310 && !reducerHealthy 311 && (!reducerProgressedEnough || reducerStalled)) { 312 LOG.fatal("Shuffle failed with too many fetch failures " + 313 "and insufficient progress!" +314 "Killing task " + getTaskID() + ".");315 umbilical.shuffleError(getTaskID(), 316 "Exceeded MAX_FAILED_UNIQUE_FETCHES;"317 + " bailing-out.", jvmContext);318 }319 320 }321 322 currentTime = System.currentTimeMillis();323 long currentBackOff = (long)(INITIAL_PENALTY *324 Math.pow(PENALTY_GROWTH_RATE, noFailedFetches));325 326 penaltyBox.put(cr.getHost(), currentTime + currentBackOff);327 LOG.warn(reduceTask.getTaskID() + " adding host " +328 cr.getHost() + " to penalty box, next contact in " +329 (currentBackOff/1000) + " seconds");330 }331 uniqueHosts.remove(cr.getHost());332 numInFlight--;333 }334 }335 336 // all done, inform the copiers to exit337 exitGetMapEvents= true;338 try {339 getMapEventsThread.join();340 LOG.info("getMapsEventsThread joined.");341 } catch (InterruptedException ie) {342 LOG.info("getMapsEventsThread threw an exception: " +343 StringUtils.stringifyException(ie));344 }345 346 synchronized (copiers) {347 synchronized (scheduledCopies) {348 for (MapOutputCopier copier : copiers) {349 copier.interrupt();350 }351 copiers.clear();352 }353 }354 355 // copiers are done, exit and notify the waiting merge threads356 synchronized (mapOutputFilesOnDisk) {357 exitLocalFSMerge = true;358 mapOutputFilesOnDisk.notify();359 }360 361 ramManager.close();362 363 //Do a merge of in-memory files (if there are any)364 if (mergeThrowable == null) {365 try {366 // Wait for the on-disk merge to complete367 localFSMergerThread.join();368 LOG.info("Interleaved on-disk merge complete: " + 369 mapOutputFilesOnDisk.size() + " files left.");370 371 //wait for an ongoing merge (if it is in flight) to complete372 inMemFSMergeThread.join();373 LOG.info("In-memory merge complete: " + 374 mapOutputsFilesInMemory.size() + " files left.");375 } catch (InterruptedException ie) {376 LOG.warn(reduceTask.getTaskID() +377 " Final merge of the inmemory files threw an exception: " + 378 StringUtils.stringifyException(ie));379 // check if the last merge generated an error380 if (mergeThrowable != null) {381 mergeThrowable = ie;382 }383 return false;384 }385 }386 return mergeThrowable == null && copiedMapOutputs.size() == numMaps;387 }388
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   该方法会构造多个线程对象:1个LocalFSMerger线程、1个InMemFSMergeThread线程、1个GetMapEventsThread线程、若干个(由"mapred.reduce.parallel.copies"决定,默认是5)MapOutputCopier线程。

  (1)先开若干个MapOutputCopier,并启动线程,加入copiers存储列表。这个线程的run方法中有个死循环,一直监控scheduledCopies列表,这个列表表示正在拷贝的map输出的列表,当scheduledCopies一旦发现有MapOutputLocation就获取第一个MapOutputLocation,调用方法copyOutput(loc)来从远程通过HTTP拷贝Map的输出数据。copyOutput(loc)方法首先检查这个MapOutputLocation是否在copiedMapOutputs和obsoleteMapIds之中,是不能拷贝的,如果在就直接返回-2;然后通过getMapOutput(MapOutputLocation mapOutputLoc, Path filename, int reduce)方法与远程taskTracker建立连接,并获取输入流,通过一系列检查之后检查内存文件系统是否可以放得下这个map输出,如果可以放得下就通过shuffleInMemory方法将这个文件放入内存,否则通过shuffleToDisk刷新到磁盘(shuffleInMemory方法会等待内存释放足够的空间并会关闭输入流再再次建立输入流,在内存中开辟空间,将map数据拷贝到这这段空间中并封装到MapOutput中,然后返回这个MapOutput;shuffleToDisk方法首先会找一个合适的本地位置来存储map的输出,然后构造一个MapOutput对象,并从输入流持续的写到输出流指定的文件中,将这个文件封装到MapOutput中,返回MapOutput)。再返回到copyOutput方法,再对返回的MapOutput做一些检查最终如果是在内存中则mapOutputsFilesInMemory.add(mapOutput);否则是在本地磁盘对其重命名并将这个文件对应的FileStatus加入mapOutputFilesOnDisk。run方法中的finally中的finish方法将已经拷贝的MapOutputLocation放入copyResults。

  (2)构造LocalFSMerger对象并启动线程,其run方法如果exitLocalFSMerge==false就会一直等待本地文件数量>=(2 * ioSortFactor - 1),会触发本地文件合并操作,ioSortFactor是参数"io.sort.factor",默认是10。然后会从 mapOutputFilesOnDisk(是SortedSet类型)中选取最小的前10个文件放入mapFiles,通过Merger.merge归并排序这10个文件,写入writer指定的文件,并将新文件放入mapOutputFilesOnDisk中。这里如果设置了combiner,也不会调用。

  (3)构造InMemFSMergeThread对象并启动线程,其run方法循环检查内存中的文件是否可以合并通过exit = ramManager.waitForDataToMerge(),如果满足以下几个条件之一就会触发合并内存文件的操作:一、数据拷贝完毕后,关闭ShuffleRamManager;二、ShuffleRamManager 中已使用内存超过可用内存的“mapred.job.shuffle.merge.percent”,默认是0.66且内存文件数目超过2个;三、内存中 的文件数目超过“mapred.inmem.merge.threshold”,默认是1000;四、阻塞在ShuffleRamManager上的请求数目超过拷贝线程数"mapred.reduce.parallel.copies"的0.75。满足条件就会调用doInMemMerge()方法来执行合并操作,该方法使用工具类Merger实现归并,如果设置了combiner,则在写入本地文件之前通过combinerRunner.combine来将排序后的数据聚集后写入writer指定的本地文件中。这里有个问题要注意就是run方法中是do-while循环,循环条件是(!exit),即当exit==false时才会持续的运行,waitForDataToMerge方法中可以看出来只有ramManager关闭之后才会返回true。

  (4)构造GetMapEventsThread对象并启动线程。此线程的run方法是每隔1s调用getMapCompletionEvents()方法直到exitGetMapEvents==true(会在fetchOutputs()中赋值true),这个方法会与TaskTracker通信调用TaskTracker.getMapCompletionEvents已经获取到的etionEvents方法获取已完成的Map Task列表:规则是先查找shouldReset有没有当前reduce task对应的ID,如果有说明要正在shuffle要回滚,则就返回一个要reset的MapTaskCompletionEventsUpdate;如果shouldReset没有,则从runningJobs中找到当前reduce task所属的Job的FetchStatus;获取新增的完成的map task列表FetchStatus.getMapEvents(fromEventId, maxLocs),从allMapEvents中获取需要的已完成的map,然后封装到这个列表到MapTaskCompletionEventsUpdate,再返回。那么allMapEvents中的数据是如何来的呢?TaskTracker有个MapEventsFetcherThread线程,其run方法会周期性的去获取runningJobs所有的job中第一个处于SHUFFLE阶段的reduce task对应job的FetchStatus,然后对每个FetchStatus调用其fetchMapCompletionEvents(currentTime)方法调用queryJobTracker(fromEventId, jobId, jobClient)方法与JobTracker通信通过JobTracker.getTaskCompletionEvents方法从JobInProgress中的taskCompletionEvents来获取满足条件的TaskCompletionEvent,从中找出是Map task的更新allMapEvents。

  getMapCompletionEvents()方法中获取到了MapTaskCompletionEventsUpdate之后,就将已完成的map列表放入TaskCompletionEvent events[]之中;如果是reset的,则重置fromEventId、obsoleteMapIds、mapLocations;然后更新fromEventId表示已经获取到已完成map的最新编号,以后再获取新增将会是这个编号之后的。然后遍历events中的所有TaskCompletionEvent,根据每个的状态:如果是SUCCEEDED,则放入mapLocations(保存了TaskTracker Host与已完成任务列表的映射关系)可以去取map的输出数据;如果是OBSOLETE/FAILED/KILLED,就放入obsoleteOutputs,表示停止从这些map取数据;如果是TIPFAILED,则放入copiedMapOutputs表示不需要从这些map去取数据。然后返回mapLocations新增的的个数。

  在fetchOutputs()方法中这些线程启动之后,还不能工作,还需要将mapLocations中合适的MapOutputLocation放入scheduledCopies唤醒MapOutputCopier线程去拷贝,如果A、所有的拷贝结果中会将拷贝成功的从fetchFailedMaps中删除;B、是Obsolete的会忽略;C、其他失败的加入retryFetches,并且对应mapTaskId的失败次数会加1,并放入mapTaskToFailedFetchesMap之中,这个结构是用来存放mapTaskId和对应的失败次数的,容错机制一:拷贝失败次数超过上限(Math.max(30, numMaps / 10))就会杀死该Reduce Task(等待调度器重新调度执行);容错机制二:一旦拷贝失败次数>=maxFetchFailuresBeforeReporting(由参数"mapreduce.reduce.shuffle.maxfetchfailures"指定,默认是10),就加入fetchFailedMaps,同时满足以下条件就会杀死这个reduce task:一、reducer所在节点不健康;二、fetchFailedMaps的大小超过上限(默认是5)或者等于所有的reducer需要的所有的map的个数减去copiedMapOutputs的大小;三、reducer没有足够的Progress或者reducer超时停滞了,容错三、如果前两个条件均不满足,则采用对数回归模型推迟一段时间后重新拷贝对应的map的输出数据,延迟时间是10000*Math.pow(1.3, noFailedFetches)),并放入penaltyBox中进行惩罚。最后待copy操作完成会做一些清理工作:会关闭ramManager,触发InMemFSMergeThread线程结束退出;exitGetMapEvents=true会使得GetMapEventsThread结束退出;exitLocalFSMerge=true会使得LocalFSMerger线程结束退出;挨个中断copiers中所有拷贝线程MapOutputCopier,清理copiers.clear()。

 

  至此reduce task算是讲解完毕,mapreduce的整个过程已经讲解了很多内容,大体的过程已知。还有许多东西没有涉及,比如恢复机制、容错机制、任务的推测、快排和归并、文件流的过程包括文件名和位置等等。后续还会继续研究。

 

  参考:1、董西成,《hadoop技术内幕---深入理解MapReduce架构设计与实现原理》

转载于:https://www.cnblogs.com/lxf20061900/p/3794514.html

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